Les industries secondaires se concentrent dans la transformation des matières ligneuses (scieries, pâtes et papiers), dans la transformation de matières minérales (fonderie, béton, carrières de pierres) et dans l’entreposage de matières dangereuses et résiduelles. Les principales industries de transformation sont la Fonderie Horne à Rouyn-Noranda (fonderie de cuivre) et l’usine de pâtes et papiers de Tembec à Témiscaming. L’industrie secondaire joue un rôle prépondérant au niveau de la gestion des eaux usées dans les villes de Rouyn-Noranda (Fonderie Horne) et de Témiscaming (Tembec).
